一、区委会所属（33个）
1、市委会（3）
乌鲁木齐市委会、昌吉市委会、石河子市委会

2、直属总支（1）
区级机关总支

3、直属支部（26）
盟机关支部、新疆大学一支部、新疆农业大学支部、新疆医科大支部、师范大学支部、新疆大学二支部、财院支部、石油学院支部、教育学院支部、塔大支部、社科院支部、科学院支部、农科院支部、水电支部、煤炭支部、有色支部、铁路支部、文化支部、杂技团支部、区人民医院支部、机电支部、克拉玛依市支部、石化支部、水校支部、环保支部、奎屯支部

4、直属小组（3）
畜牧小组、伊犁小组、博乐小组

二、三个市委会所属

? 1、乌鲁木齐市：
友谊医院支部、北门卫生支部、高教支部、中教支部、机关文化支部

2、昌吉市
昌吉市支部、州机关支部、科技支部、昌吉学院支部、州技术学院支部、物探队支部、毛纺厂支部、州医院支部、五家渠小组

3、石河子市
总支——石河子大学总支委员会
下辖：农学院支部（下设一小组、二小组）、医学院支部、市直属支部、中教支部、机关支部、企业支部